cellranger mkfastq --id= <output_name> \
                   --run= <path_to_data_folder> \
                   --csv= <samplesheet.csv>

cellranger count --id= <output_name> \
                 --fastqs= <path_to_fastq_folder> \
                 --sample= <Sample_name> \
                 --transcriptome= <path_to_ref_folder>

cellranger aggr --id= <output_name> \
                --csv== <aggr-sheet.csv> \
                --normalize=mapped